Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms