Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc190Q3URK1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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