Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms