Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms