Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ell2Q3UKU1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ell2Q3UKU1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms