Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp19Q3UJD6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms