Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Nkx6-3Q3UHX8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nkx6-3Q3UHX8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nkx6-3Q3UHX8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nkx6-3Q3UHX8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nkx6-3Q3UHX8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Nkx6-3Q3UHX8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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