Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Gtpbp6Q3U6U5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Gtpbp6Q3U6U5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Gtpbp6Q3U6U5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Gtpbp6Q3U6U5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Gtpbp6Q3U6U5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Gtpbp6Q3U6U5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp6Q3U6U5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms