Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U595 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Q3U595 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Q3U595 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U595 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q3U595 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q3U595 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q3U595 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Q3U595 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Q3U595 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U595 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U595 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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