Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Kdm4dQ3U2K5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Kdm4dQ3U2K5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms