Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U1D9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U1D9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q3U1D9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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