Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms