Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc28Q3TX51 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms