Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TchpQ3TVW5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms