Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms