Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms