Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms