Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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