Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms