Protein–RNA interactions for Protein: Q208S0

Teddm2, Epididymal protein Me9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm2Q208S0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Teddm2Q208S0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Teddm2Q208S0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms