Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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