Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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ptchd1Q14B62 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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ptchd1Q14B62 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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ptchd1Q14B62 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ptchd1Q14B62 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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