Protein–RNA interactions for Protein: Q0WXH6

Gm7030, MHC class Ib T9, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7030Q0WXH6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm7030Q0WXH6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7030Q0WXH6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7030Q0WXH6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7030Q0WXH6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm7030Q0WXH6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms