Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms