Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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