Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms