Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms