Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms