Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnnm1Q0GA42 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cnnm1Q0GA42 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnnm1Q0GA42 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnnm1Q0GA42 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnnm1Q0GA42 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnnm1Q0GA42 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnnm1Q0GA42 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnnm1Q0GA42 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms