Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Chd8Q09XV5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Chd8Q09XV5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd8Q09XV5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd8Q09XV5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd8Q09XV5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd8Q09XV5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd8Q09XV5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd8Q09XV5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd8Q09XV5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd8Q09XV5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd8Q09XV5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chd8Q09XV5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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