Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssrp1Q08943 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms