Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms