Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms