Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col9a2Q07643 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col9a2Q07643 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms