Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp2Q06649 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms