Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms