Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPINDOCQ05AH6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms