Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a1Q05722 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a1Q05722 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms