Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smarcad1Q04692 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms