Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd1Q04519 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms