Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnb1Q03717 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms