Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms