Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgfr4Q03142 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgfr4Q03142 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms