Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col6a2Q02788 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms