Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RykQ01887 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RykQ01887 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RykQ01887 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RykQ01887 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RykQ01887 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RykQ01887 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RykQ01887 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms