Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VcpQ01853 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms