Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd1Q01822 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms