Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme2Q01768 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms