Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp1Q01514 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms