Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms